Segundo o Banco Central do Brasil, a taxa de juros do cheque especial chegou a 286,9%, ao ano. As taxas do rotativo de cartões de crédito e do cheque especial são as mais caras do mercado, não sendo uma boa alternativa essa modalidade de crédito. Utilizar-se de um crédito pessoal para quitação de dívidas oriundas do cheque especial são muito difundidas hoje em dia, por ser uma modalidade de crédito que opera com taxas de juros mais reduzidas.
Desde julho de 2018, os clientes que utilizam mais de 15% do limite do cheque durante 30 dias consecutivos passaram a receber uma oferta de parcelamento, com taxa de juros menores que a do cheque especial definida pela instituição financeira.